在民進黨和時代力量要求在未釐清遴選過程疑義前，教育部不得進行後續聘任作業，插手我國神聖的最高學府殿堂的大學校長人事案後，民進黨立法委員張廖萬堅跳出來召開記者會指出，管中閔與暨南大學管理學院院長陳建良去年5月共同發表《兩岸經濟合作架構協議（ECFA）政策效果評估國際貿易實證》，但文章卻與2016年7月另一暨南大學碩士班張姓學生的論文十分類似，有20多處雷同，而該名學生正是陳建良的指導學生，指稱管中閔抄襲論文，自由時報更在未經查證下刊登頭版發行公眾。
許多有心人士幾乎是同時，一起跳出來要求管中閔應該自重，主動放棄新當選的臺灣大學校長一職。
然而，有學術研究者透過臺灣博碩士論文知識加值系統發現，張生的論文電子資料中的參考文獻中根本就有「陳建良與管中閔 (2016)，『兩岸經濟合作架構協議 (ECFA) 政策效果評估』手稿」的引用，顯示該生的論文內容根本引用管中閔、陳建良的文章，而非後者抄襲前者。
同時陳建良教授也出面表示，管中閔的論文內容確實並非抄襲。
民進黨立委張廖萬堅指責管中閔抄襲學生論文，被學者發現是烏龍抹黑
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